我国科研团队发现微小eccDNA可作为具有临床应用价值的肿瘤标志物

      eccDNA全名是染色体外环状DNA（extrachromosomal circular DNA）。这种DNA是细胞内染色体的一个特殊形式，它与传统的线性染色体DNA不同。eccDNA通常是由线性染色体DNA的环化而来，形成闭合的环状结构。近年来，研究人员对eccDNA的功能和影响进行了广泛的研究。它们可能参与了基因调控、遗传多样性以及与疾病如癌症的关联等方面。eccDNA在细胞内的生物学角色还在不断地被探索和理解中。

     今日在《Clinical and Translational Medicine》杂志发表了一篇题为题为“Small Extrachromosomal Circular DNAs as Biomarkers for Multi-Cancer Diagnosis and Monitoring”的文章，这篇文章讨论了小型细胞外环形DNA（eccDNA）在多种癌症诊断和监测中作为生物标志物的潜力。文章的作者包括北京医院、北京大学第五临床医学院、中国医学科学院北京老年医学研究所等单位的专家等。

      他们构建了一个高效的小型eccDNA全长测序平台，并发现在同一患者的血浆和癌组织中共享的小型eccDNA不到0.01%。研究还表明，在组织和血浆中，小型eccDNA结合CEA/CA19-9水平具有很高的多癌种诊断价值。这项研究为多癌种的诊断和治疗提供了新的见解和可能的方法。

      研究表明，eccDNAs可以作为独立且稳定的环状DNA分子，在组织和血浆中均可用作理想的标志物。eccDNAs在癌症组织和癌旁组织中的数据，结合远离肿瘤的外周血中的数据，可以为我们更深入地了解eccDNAs的传输和流动提供丰富的资源，并为癌症特异性eccDNA标志物的合理开发铺平道路。

     在多个癌症类型中，eccDNAs的存在和特定基因的起源与癌症之间存在相关性。这些共享的小型eccDNAs有潜力成为新的癌症特异性标志物。研究发现，从ALK&ETV6基因发起的小型eccDNAs在癌症组织中具有很高的多癌症诊断价值，并且在血浆中也显示出很高的阳性预测值（100%）和阴性预测值（82.35%）。此外，通过分析癌症血浆和配对组织中小型eccDNAs的序列相似性，进一步验证了这些共享的eccDNAs可作为癌症特异性标志物的潜力。此外，通过与CEA/CA19-9的组合，结合一些特定基因来源的小型eccDNAs，可显著提高诊断癌症的准确性，有潜力成为经济高效的非侵入性多癌症筛查和监测方法。

     论文信息：Xuanmei Luo, Lili Zhang, Jian Cui, Qi An, Hexin Li, Zaifeng Zhang, Gaoyuan Sun, Wei Huang, Yifei Li, Chang Li, Wenzhuo Jia, Lihui Zou*, Gang Zhao*, Fei Xiao*. Small extrachromosomal circular DNAs as biomarkers for multi-cancer diagnosis and monitoring. Clinical and Translational Medicine. 2023. 13 (9): e1393.

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